Quelles sont les missions ?

Dans le cadre de notre approche de découvertes de nouveaux médicaments, au sein du pôle d'activités Data Sciences & Data Management, dans l'unité de recherche in Vitro Pharmacology, nous souhaitons proposer un stage visant à développer l'analyse d'image pour la transcriptomique spatiale. Cette technique permet la mesure de l'expression des gènes combiné à une localisation spatiale au sein de coupes tissulaires avec une résolution proche du cellulaire. Il en résulte une grande volumétrie, dimensionalité et complexité des données générées.
L'objectif de ce stage est d'analyser les images reconstruites à partir de cette technique et de mettre en place des algorithmes d'analyses de données issus des images dans un environnement computationnel.
 Une interdisciplinarité entre Informatique et Biologie sera nécessaire pour couvrir les ambitions de ce projet qui prendra place dans le cadre de nos activités de recherche.
 
Le stage d'une durée de 6 mois commencera en janvier 2023 (date sujette à flexibilité) à Suresnes (92) dans un premier temps puis transfert de nos activités sur notre nouveau centre de R&D à Saclay (91) à partir de mi-mars 2023. 

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Quel est le profil idéal ?

Vous êtes étudiant(e) en Master2 Informatique ou diplôme Ingénieur, Data science appliquée à la biologie, Bio-informatique et vous recherchez un stage de 6 mois ?
Vous avez des compétences en Analyse d'image biologique, Informatique, Biologie ?
Des compétences en programmation (Python) et gestion des données ?
Vous avez une forte sensibilisation au machine learning (réduction de dimensions, apprentissage automatique supervisé et non-supervisé) ?
Vous avez des connaissances en environnements Cloud, Linux, Python ?
Vous faites preuve de curiosité, d'autonomie, d'esprit d'équipe ?
Alors ce poste est fait pour vous !

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