Quelles sont les missions ?

Au sein du stage, vous vous familiariserez d'abord avec les travaux antérieurs, la modélisation de réseaux métaboliques et l'avancement des recherches académiques, ensuite vous explorerez cette nouvelle approche en partant du systèmes digestive et sa composante microbienne. Le travail de méthodologie sera accompagné par l'implémentation d'un prototype du modèle virtuel, suivi par une phase d'interprétation des résultats obtenus et une phase de défi de son comportement pour augmenter notre compréhension du fonctionnement humain.


Références :
- Ines Thiele, Swagatika Sahoo, Personalized whole-body models integrate metabolism, physiology, and the gut microbiote. Molecular systems biology. (2020)
- Heinken, A., Ravcheev, D.A., Baldini, F. et al, Systematic assessment of secondary bile acid metabolism in gut microbes reveals distinct metabolic capabilities in inflammatory bowel diseases. Microbiome (2019)
- Gottstein et al. Constraint-based stoichiometric modelling from single organisms to microbial communities. J R Soc Interface. 2016 Nov; 13(124).
- Orth JD et al. What is flux balance analysis?, 2010, Nat. Biotechnol. 28, 245-248.

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Quel est le profil idéal ?

De bonnes connaissance en Modélisation mathématique et statistique
Excellent niveau de programmation Python
De bonnes notions en Linear programming

Votre candidature aura un atout supplémentaire, si vous avez :

Des connaissances de base en biologie
Travaillé sur la modélisation & analyse de réseaux métaboliques
Travaillé avec des données biologiques
Créativité et esprit collaboratif dans l'échange d'idées avec les autres membres du département Healthcare & Life Sciences Research.
Autonomie et force de propositions pour la mise en oeuvre du prototype
Rigueur et autonomie dans votre conduite technique du stage.

Comparer votre profil avec les candidats qui ont déjà postulé

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